Jornal de Patologia Vegetal e Microbiologia

Abstrato

Caracterização de rizobactérias associadas ao tomateiro recuperadas de vários locais de cultivo de tomate na Tunísia

Nada Ouhaibi-Ben Abdeljalil, Jessica Vallance, Jonathan Gerbore, Emilie Bruez, Guilherme Martins, Patrice Rey e Mejda Daami-Remadi

No presente estudo, um total de 200 isolados rizobacterianos foram obtidos da rizosfera de plantas de tomate saudáveis ​​cultivadas em campos com histórico de doenças graves transmitidas pelo solo e principalmente podridões da coroa e da raiz. Examinada sua capacidade de suprimir o crescimento in vitro de Sclerotinia sclerotiorum e Rhizoctonia solani, 69 e 57 isolados dos 200 testados mostraram-se capazes de inibir significativamente o crescimento micelial de patógenos alvo em 11-62% em relação ao controle. Os 25 isolados mais eficazes, levando à supressão de ambos os fungos em mais de 45% em relação ao controle, foram selecionados e submetidos a caracterizações morfológicas, bioquímicas, moleculares e metabólicas. Esta coleção de rizobactérias associadas ao tomate exibiu uma grande diversidade morfológica e bioquímica. O sequenciamento dos genes 16S rRNA e rpoB levou à identificação de quatro gêneros, a saber, Bacillus, Chryseobacterium, Enterobacter e Klebsiella. As espécies mais frequentes foram B. amyloliquefaciens, B. thuringiensis, B. megaterium, B. subtilis, E. cloacae, C. jejuense e K. pneumoniae. Na triagem de suas propriedades promotoras de crescimento de plantas, 20 isolados mostraram-se capazes de produzir sideróforo, 18 tinham fosfato solubilizado e 19 eram capazes de sintetizar ácido indol-3-acético (IAA). A amplificação por PCR de genes biossintéticos de lipopeptídeos revelou a presença de genes que codificam a biossíntese de fengicina A e bacilomicina D em 18 e 16 isolados, respectivamente. A caracterização metabólica realizada usando Biolog™ Ecoplates indicou que as rizobactérias associadas ao tomate apresentaram uma grande atividade metabólica e foram capazes de usar uma ampla gama de fontes de carbono com o aumento da duração da incubação. Com base em seus perfis metabólicos, esses isolados rizobacterianos foram agrupados em oito grandes grupos gerados em diferentes tempos de amostragem (24, 48 e 120 h de incubação). Os valores de desenvolvimento médio de cor de poço (AWCD) foram considerados positivamente correlacionados com o índice de diversidade de Shannon.