Jornal de Pesquisa e Desenvolvimento em Aquicultura

Abstrato

Caracterização da comunidade microbiana procariótica e eucariótica em lagoas de camarão branco do Pacífico

Dongwei Hou, Shenzheng Zeng, Jian Liu, Muting Yan, Shaoping Weng, Jianguo He Jianguo He e Zhijian Huang

Esta pesquisa perfila as composições comunitárias e taxonomias dominantes de micróbios procarióticos e eucarióticos em 30 amostras de água de 5 diferentes lagoas de camarão branco do Pacífico. A região V4 do gene 16S rRNA e do gene 18S rRNA foram sequenciadas por tecnologia de sequenciamento de alto rendimento. Um total de 1.387.317 fragmentos do gene 16S rRNA e 1.612.056 18S rRNA foram selecionados para classificação, incluindo 3.841 Unidades Taxonômicas Operacionais (OTUs) procarióticas e 990 OTUs eucarióticas. Observou-se que todas as sequências 16S rRNA foram afiliadas a pelo menos 47 divisões de bactérias e as sequências 18S rRNA foram afiliadas a 50 divisões eucarióticas, respectivamente. Entre todas as 30 amostras, a comunidade procariótica e eucariótica dominante no nível de filo compartilhou similaridade considerável em composição, mas não em abundância. A comunidade procariótica dominante incluiu Actinobacteria, Proteobacteria, Cyanobacteria, Planctomycetes, Verrucomicrobia, Bacteroidetes, Chlorobi, Chloroflexi, Firmicutes e Spirochaetes. Cercozoa, Chlororhyta, Arthropoda, Stramenopiles-unidentified, Fungi-unidentified, Prymnesiophyceae, Ciliophora, Mollusca, Choanomonada e Jakobida foram as composições dominantes do eucariótico. Da mesma forma, diferença significativa existiu no nível de gênero entre as 30 amostras. Os resultados de riqueza e diversidade mostraram que os micróbios procarióticos e eucarióticos possuíam composições comunitárias complexas em 5 lagoas. Enquanto em diferentes períodos e diferentes lagoas, o valor do índice de Chao, Ace, Shannon e Simpson não foi significativamente diferente (P > 0,05).