Dinesh Singh, Shweta Sinha, Garima Chaudhary e Yadav DK
Ralstonia solanacearum biovars 3 e 4 causando murcha bacteriana do tomateiro (Solanum lycopersicum L.) é um patógeno de planta devastador transmitido pelo solo em todo o mundo. Oitenta e sete isolados de R. solanacearum foram isolados de plantas de tomate murchas dos estados de Jammu e Caxemira, Himachal Pradesh, Uttarakhand, Jharkhand, Orissa da Índia e os caracterizaram por métodos tradicionais e moleculares. Biovar de R. solanacearum foi determinado usando um conjunto de fontes de carbono e mostrou que biovar 3 de R. solanacearum foi encontrado mais proeminente (90,2 por cento) em todos os estados da Índia, enquanto biovar 4 foi encontrado nos estados de Jharkhand e Himachal Pradesh. O PCR multiplex específico do filotipo atribuiu todos os 87 isolados de R. solanacearum infectando tomate sob o filotipo I. Para estudar a diversidade genética, foram utilizadas abordagens de BOX-PCR e tipagem de sequência multilocus. Os produtos de amplificação renderam no padrão de impressão digital BOX-PCR variando de 500 pb a 4 kb e encontraram 23 grupos de tipagem de DNA de 87 isolados de R. solanacearum com coeficiente de similaridade de 50%. Sob tipagem de sequência multilocus, três genes de virulência, a saber, hrp (regulação da transcrição regulatória) e egl (precursor da endoglucanase) e genes fli C de 18 cepas de R. solanacearum pertencentes a diferentes zonas agroclimáticas foram feitos. Com base na análise de sequência do gene egl, a maioria das cepas indianas de R. solanacearum eram muito próximas umas das outras, exceto ORT-8, UTT-23 e JHT2, e eram muito próximas da cepa GMI1000. Muita variabilidade genética foi encontrada em isolados indianos de R. solanacearum, independentemente do local de isolamento e das condições climáticas.