Davit Bzhalava e Joakim Dillner
A deteção da presença de vírus conhecidos e desconhecidos em bioespécimes é hoje realizada de rotina com recurso à metagenómica viral. Uma vez que a velocidade de sequenciação e o custo por base estão a diminuir rapidamente com as novas tecnologias de sequenciação de nova geração, como o HiSeq (Illumina), 454 GS FLX (Roche), SOLiD (ABI) e Ion Torrent Proton (Life Technologies), o a análise bioinformática é hoje uma parte mais importante e cada vez mais exigente da análise metagenómica viral. Nesta revisão, destacamos alguns dos principais desafios e as ferramentas de bioinformática mais comummente adaptadas para a metagenómica viral.