Journal of Data Mining in Genomics & Proteomics

Abstrato

Tentativa de validação de biomarcadores de cinesina derivados de ionização de dessorção laser melhorada de superfície e tempo de voo no mesotelioma maligno

Stephen M. Brindley, Brian C. Tooker, Harvey I. Pass e Lee S. Newman

A espectrometria de massa com dessorção/ionização a laser melhorada por superfície (SELDI-TOF) permite aos investigadores pesquisar proteomas em busca de biomarcadores de doenças. A validação dos resultados do SELDI-TOF utilizando metodologias tradicionais produziu resultados mistos. Foram utilizados ensaios de PCR em tempo real, ELISA e Western blot na tentativa de confirmar a ligação entre os cancros relacionados com o amianto e as proteínas da família das cinesinas, KIF5A e KIF18A. Estas proteínas foram identificadas utilizando SELDI-TOF e Análise de Árvore de Classificação e Regressão (CART) em soro de doentes com cancros relacionados com o amianto. Quando fibras de amianto bem caracterizadas foram utilizadas para desafiar as linhas celulares mesoteliais, foram observados resultados mistos na expressão de RNA KIF5A e KIF18A. A análise de Western blot comparando os níveis proteicos em linhas celulares de mesotelioma versus células mesoteliais transformadas produziu resultados inconclusivos, assim como as análises de Western blot de mesotelioma humano e peritoneu não canceroso que foram obtidas dos mesmos doentes. Estes resultados sugerem que é improvável que as proteínas da família das cinesinas detectadas pelo SELDI-TOF CART sejam úteis como biomarcadores para o mesotelioma maligno.