Jornal de Patologia Vegetal e Microbiologia

Abstrato

Aplicação e avaliação do ensaio de amplificação isotérmica mediada por loop para a detecção de fungos aflatoxigênicos contaminantes de grãos de arroz no Quênia

Youmma Douksouna*, Allan Ole Kwallah, Andrew Nyerere, Steven Runo

Os fungos aflatoxigênicos são os fungos filamentosos mais comuns que sintetizam aflatoxinas e representam os principais patógenos fúngicos para produtos agrícolas. As aflatoxinas continuam sendo uma grande ameaça à segurança alimentar global, essas moléculas podem ser resistidas em alimentos durante o processamento e, além disso, podem permanecer na cadeia alimentar. As aflatoxinas são cancerígenas, hepatotóxicas, mutagênicas, teratogênicas, podem inibir vários sistemas metabólicos e propriedades imunossupressoras. Estudos de cepas aflatoxigênicas podem ajudar a aprimorar estratégias de controle e prevenir a contaminação por fungos aflatoxigênicos e a produção de aflatoxinas em alimentos. Neste estudo, o isolamento de espécies de Aspergillus foi baseado em características morfológicas, incluindo o padrão de crescimento do micélio, cor e propriedades dos corpos de frutificação dos fungos. A técnica inovadora de ensaio de amplificação isotérmica mediada por loop foi aplicada para amplificar o gene do ácido norsolorínico. A amplificação isotérmica mediada por loop foi otimizada pela combinação de rapidez, simplicidade e especificidade para detectar o DNA genômico alvo nas reações. As curvas de amplificação monitoradas pelo Turbidímetro em tempo real Loopamp foram analisadas para distinguir cepas aflatoxigênicas e não aflatoxigênicas.

No geral, os resultados mostraram que o método de amplificação isotérmica mediada por loop foi eficaz na detecção de cepas aflatoxigênicas com alta especificidade de 71,5% e sensibilidade sob concentrações mais baixas de DNA. Além disso, foi mais rápido do que a reação em cadeia da polimerase convencional. O ensaio de amplificação isotérmica mediada por loop descrito neste estudo pode ser uma ferramenta promissora para prever ameaças potenciais por fungos aflatoxigênicos e risco de aflatoxinas em alimentos e commodities.