Journal of Data Mining in Genomics & Proteomics

Abstrato

Análise e mutação de códon nos genes rpoB e katG e estudo bioinformático do modelo de ligação RIF pela subunidade RNA β polimerase: estudo em doentes com tuberculose no Merauke General Hospital-Indonésia

Kawulur HSI e Ngili Y

O tratamento dos doentes com TB é geralmente feito com a administração de três tipos de medicamentos antituberculosos, sendo as principais opções a Rifampicina (RIF) e a Isoniazida (INH), seguidas da estreptomicina ou da pirazinamida. A resistência ao RIF é atribuível à mutação do gene rpoB, o gene que produz a subunidade β da RNA polimerase, e a resistência à INH deve-se em grande parte à mutação do gene katG. O objetivo deste estudo foi obter informações sobre a associação da TB-MDR com genes relacionados, bem como informações sobre a combinação do genótipo Mycobacterium tuberculosis em doentes com tuberculose em Merauke. Aqui relatamos que a maioria dos isolados de MDRTB são resistentes a outros fármacos antituberculosos, e a frequência de mutação de rpoB526 e rpoB531 (mutações que ocorrem em ambos os lados/neste local ocorrem quase sempre em conjunto) é quase a mesma, mas a mutação katG315 está presente em apenas 16 isolados (o número de mutações que ocorrem no katG315 é inferior ao do rpoB526 e rpoB531). A presença de alterações no nucleótido C1363A no Mycobacterium tuberculosis sensível de seis fármacos antituberculosos mostrou que nem todas as mutações rpoB causaram resistência. Com base neste fenómeno, pode-se propor que o mecanismo de formação de estirpes de TB-MDR começa com uma mutação rpoB seguida por uma mutação de katG. Este estudo demonstra que o mecanismo de resistência a um fármaco que afeta apenas um gene, como a rifampicina, que afeta o rpoB, é mais facilmente controlado do que os fármacos antituberculosos que afetam vários genes, como a isoniazida, que afeta outros genes para além do katG.