Jornal de Patologia Vegetal e Microbiologia

Abstrato

Amplificação, clonagem e predição in silico do gene elicitina de comprimento total de Phytophthora capsici, o agente causal da doença da podridão do pé da pimenta-do-reino

Vijesh Kumar IP, Reena N, Anandaraj M, Eapen SJ, Johnson GK e Vinitha KB

Elicitinas são uma família de pequenas proteínas secretadas por Phytophthora, que induzem necrose foliar em plantas infectadas. Aqui, relatamos a clonagem do gene Elicitina de P. capsici, um patógeno vegetal Oomycete que causa danos significativos a uma ampla gama de plantas hospedeiras. A sequência de elicitina foi amplificada usando primers projetados a partir dos genes Elicitina conhecidos de outros organismos Phytophthora com base em seus motivos conservados. O tamanho do produto amplificado por PCR de 256 pb de comprimento e a análise BLAST do produto sequenciado mostraram correspondência perfeita com sequências de alfa-elicitina de P. capsici. Posteriormente, foi feita uma tentativa de caracterizar o gene completo da elicitina a partir de informações da sequência do genoma de P. capsici, consultando o produto amplificado contra o genoma. A busca BLAST local contra o genoma completo identificou a sequência de codificação inteira. Análises de sequência posteriores identificaram a sequência promotora, o sítio de início da transcrição, uma sequência de sinal líder e um domínio de elicitina central, com 6 resíduos de cisteína conservados. Além disso, a estrutura tridimensional da capsiceína foi modelada, e a afinidade de ligação do esterol e da capsiceína foi estudada usando docking molecular. O modelo desenvolvido previu forte afinidade de ligação para Tyr 47.