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Abstrato
AFLP Fingerprinting para identificação de grupos de infra-espécies de Rhizoctonia solani e Waitea circinata
Bimal S. Amaradasa, Dilip Lakshman e Keenan Amundsen
Doenças de manchas causadas por Thanatephorus cucumeris (Frank) Donk e Waitea circinata variedades Warcup e Talbot (anamorfos: espécies Rhizoctonia) representam uma séria ameaça à manutenção bem-sucedida de várias espécies importantes de gramados. Confiar em sintomas de campo para identificar agentes causais de Rhizoctonia pode ser difícil e enganoso. Diferentes espécies de Rhizoctonia e Grupos de Anastomose (AGs) variam em sensibilidade a fungicidas comumente aplicados e também têm diferentes faixas de temperatura propícias para causar doenças. Portanto, a identificação correta do patógeno causal é importante para prever a progressão da doença e tomar futuras decisões de manejo da doença. Agrupar espécies de Rhizoctonia por reações de anastomose é difícil e demorado. A identificação de isolados de Rhizoctonia por sequenciamento da região do espaçador transcrito interno (ITS) pode ser proibitiva em termos de custo. Alguns isolados de Rhizoctonia são difíceis de sequenciar devido ao polimorfismo da região ITS. O Polimorfismo de Comprimento de Fragmento Amplificado (AFLP) é um método de impressão digital confiável e econômico para investigar a diversidade genética de muitos organismos. Nenhuma análise detalhada foi feita para determinar a adequação do AFLP para inferir o nível de infraespécie de isolados de Rhizoctonia. O objetivo do presente estudo foi desenvolver a impressão digital AFLP para identificar o nível de infraespécie de isolados desconhecidos de R. solani Kühn e W. circinata. Setenta e nove isolados previamente caracterizados de R. solani (n=55) e W. circinata (n=24) foram analisados com marcadores AFLP gerados por quatro pares de primers. O Método de Grupo de Pares Não Ponderados com Média Aritmética (UPGMA) agrupou corretamente os isolados de R. solani e W. circinata de acordo com seu AG, subgrupo AG ou variedade W. circinata. A análise de componentes principais (PCA) corroborou os clusters UPGMA. Até onde sabemos, esta é a primeira vez que a análise AFLP foi testada como um método para decifrar o AG, o subgrupo AG ou a variedade W. circinata em uma ampla gama de isolados de Rhizoctonia.