Genética hereditária: pesquisas atuais

Abstrato

Ativação de retrotransposões do grupo Ty1-copia de Dendrobium officinale em condições de stress abiótico

Cong Li, Yuan Jiang, Yanhui Gao, Jinping Si

Utilizando o iniciador universal Ty1-copia retrotransposon transcriptase reversa (RT), o domínio conservado da transcriptase reversa de cerca de 260 pb, que foi induzido pelo stresse frio e stresse osmótico, foi amplificado por RTPCR do Dendrobium officinale neste estudo, indicando que o retrotransposon pode ser ativado por condições de stress. Os amplicons foram recuperados e clonados para sequenciação e análise por software bioinformático relacionado. Foram obtidos 78 RTs de retrotransposão tipo Ty1-copia ativados transcricionalmente com elevada heterogeneidade. O comprimento destas sequências variou entre 245 a 265 pb, todas as sequências eram ricas em AT e a homologia variou entre 42,9% a 99,2%. O mesmo para Ty1-copia como retrotransposão RT do genoma, diferentes elementos reguladores de ação cis induzidos por condições de stress e os sinais de transcrição iniciais, correspondentes à caixa CAAT, sequências conservadas da caixa TATA e alguns outros elementos reguladores. Os elementos reguladores de ação cis induzidos por condições de stress da transcriptase reversa ativada transcricionalmente de retrotransposões Ty1-copia foram significativamente aumentados do que o RT de retrotransposão tipo Ty1-copia do genoma. Quando traduzidas em aminoácidos, algumas sequências apresentaram mutação no códon de paragem e/ou mutação frameshift, e todas as sequências apresentaram mutação na sequência conservada "SLYGKQ". Foram identificadas quatro categorias através de análise filogenética após análises de alinhamento das suas sequências de aminoácidos, e com RT de retrotransposão tipo Ty1-copia do genoma com baixa homologia, o que indicou que a transcriptase reversa ativada transcricionalmente de retrotransposões Ty1-copia, que induzida em condições de stress, tiveram diferenças significativas com o Ty1-copia como retrotransposão RT do genoma.