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Abstrato
Um novo servidor web para identificação rápida de microrganismos
Olivier Croce, François Chevenet e Richard Christen
As sequências genéticas de RNA ribossómico de subunidade pequena (SSU rRNA) são agora amplamente utilizadas para identificar organismos microbianos. No entanto, as bases de dados públicas compreendem agora principalmente sequências genéticas de ARNr resultantes de PCR e clonagem de ADN isolado a partir de amostras ambientais. A maioria destas sequências está mal anotada e não possui atribuições taxonómicas adequadas. Como resultado, esta inundação de sequências torna as identificações de rotina muitas vezes muito fastidiosas.
Propomos um novo servidor web para identificações rápidas e fiáveis de isolados microbianos. Permite recuperar sequências relacionadas e as suas taxonomias, para proceder a análises filogenéticas. Esta ferramenta web baseia-se em bases de dados específicas de espécies cultivadas para Bactérias, Archaea e Protozoários. Além disso, podem ser descarregados vários dados que ajudam no procedimento de identificação. O servidor também inclui software online para exibir automaticamente árvores filogenéticas anotadas.