Indexado em
- Banco de Dados de Periódicos Acadêmicos
- Abra o Portão J
- Genamics JournalSeek
- JournalTOCs
- Bíblia de pesquisa
- Diretório de Periódicos de Ulrich
- Biblioteca de periódicos eletrônicos
- RefSeek
- Universidade de Hamdard
- EBSCO AZ
- OCLC- WorldCat
- Scholarsteer
- Catálogo online SWB
- Biblioteca Virtual de Biologia (vifabio)
- publons
- MIAR
- Fundação de Genebra para Educação e Pesquisa Médica
- Euro Pub
- Google Scholar
Links Úteis
Compartilhe esta página
Folheto de jornal
Periódicos de Acesso Aberto
- Agro e Aquicultura
- Alimentos e Nutrição
- Bioinformática e Biologia de Sistemas
- Bioquímica
- Ciência de materiais
- Ciencias ambientais
- Ciências Clínicas
- Ciências Farmacêuticas
- Ciências gerais
- Ciências Médicas
- Cuidados de enfermagem e saúde
- Engenharia
- Genética e Biologia Molecular
- Gestão de negócios
- Imunologia e Microbiologia
- Neurociência e Psicologia
- Química
Abstrato
Uma abordagem computacional para a identificação de microRNAs em plantas: combinação de previsões baseadas no genoma com dados de RNA-Seq
Jorge S Oliveira, Nuno D Mendes, Victor Carocha, Clara Graça, Jorge A Paiva e Ana T Freitas
Os microRNAs são moléculas endógenas que atuam silenciando os RNAs mensageiros direcionados e que têm um importante papel regulador em muitos processos fisiológicos em plantas e animais. Aqui, propomos um pipeline que faz uso do CRAVELA, uma ferramenta de localização de microRNAs de genoma único originalmente desenvolvida para a descoberta de microRNAs em animais, e um algoritmo de análise de dados NGS que fornece uma nova função de pontuação para avaliar o perfil de expressão de candidatos, aproveitando a abundância relativa esperada de fragmentos de RNA originários da sequência madura, em comparação com outras porções do precursor do microRNA. Esta abordagem foi testada em Eucalyptus spp. para os quais, apesar da sua importância económica, não foi documentado qualquer microRNA. O resultado da nossa abordagem foi uma pequena lista de candidatos, incluindo sequências conservadas e não conservadas. A validação experimental mostrou amplificação em 6 dos 8 candidatos escolhidos entre as sequências não conservadas com melhor pontuação.