Xiaohui Chen Nielsen, Derya Carkaci, Rimtas Dargis, Lise Hannecke, Ulrik Stenz Justesen, Michael Kemp, Jens Jørgen Christensen e Monja Hammer
As espécies que são cocos catalase-negativos, gram-positivos e não pertencentes a estreptococos ou enterococos têm vindo a ser cada vez mais bem caracterizadas e o número de entidades taxonómicas cresce constantemente com base em estudos taxonómicos moleculares. Isso complica a sua identificação. A análise da sequência da região do espaçador intergénico 16S-23S (ITS) revelou ser uma ferramenta útil para a identificação de espécies dos géneros Streptococcus e Enterococcus. Este estudo investigou a possibilidade de utilizar a análise de sequências ITS como uma ferramenta comum para a identificação de espécies dentro dos géneros Aerococcus, Abiotrophia, Alloiococcus, Dolosicoccus, Dolosigranulum, Facklamia, Granulicatella, Gemella, Ignavigranum, Leuconostoc e Vagococcus. Foram determinadas sequências ITS de 29 estirpes do tipo e 103 estirpes clínicas bem caracterizadas e realizada a análise BLAST para identificação das espécies. Todas as estirpes clínicas foram identificadas de forma convincente ao nível de espécie. A análise filogenética mostrou um agrupamento distinto de estirpes com as espécies alocadas e as respetivas estirpes-tipo. Assim, a análise da sequência ITS foi útil para a identificação de espécies de bactérias pertencentes aos géneros que são cocos catalase-negativos e gram-positivos. Potencialmente, o ITS poderá ser considerado como a ferramenta de identificação de primeira linha para o grupo de cocos gram-positivos e catalase-negativos, incluindo estreptococos não hemolíticos, enterococos e os taxa examinados neste estudo.